Når man deltager i Operation Paratuberkulose anbefales det, at man iværksætter en række tiltag, som beskytter modtagelige dyr imod smitte fra potentielt smittefarlige dyr. Anbefalingerne er generelle, og kræver tilpasning i den enkelte besætning. Hvordan tiltagene bedst tilpasses besætningen, kan afdækkes ud fra en risikovurdering. Det vil sige en vurdering af, hvor i besætningen risikoen for smitteoverførsel er størst. En sådan risikovurdering er beskrevet i en rådgiver-manual til håndtering af Paratuberkulose og Salmonella Dublin.

De primære smitteforebyggende tiltag, som anbefales at iværksætte i Operation Paratuberkulose er følgende:

7-punktsplan, når der testes 4 x årligt og opdeles i Røde, Gule og Grønne køer

1. Røde køer udsættes (inden næste kælvning)
2. Kalve fjernes inden to timer fra Gule (og Røde^*)
3. Gules (og Rødes^*) kælvningsboks renses efter kælvning
4. Gule (og Røde^*) kælver adskilt fra andre
5. Ingen råmælk fra Røde og Gule
6. Ingen celletalsmælk fra Røde og Gule
7. Undlad indkøb, eller køb ind fra besætninger med lav forekomst

^*) Hvis enkelte Røde får lov at kælve igen